הפתיחות הגוברת כלפי תורות מזרחיות מחד ואכזבה חלקית מיעילותה של הרפואה הקונבנציונלית מאידך הביאו לפריחה של הרפואה האלטרנטיבית בעולם המערבי ובישראל. טיפולי רפואה אלטרנטיבית אינם כלולים בסל הבריאות ולכן עלותם גבוהה. עבור חלקה מטיפולים אלו ישנו כיסוי במסגרת ביטוח בריאות משלים.
בניגוד לרפואה ההקונבנציונלית, לא קיימת בישראל מערכת של פיקוח על תכניות הלימודים של הרפואה האלטרנטיבית, בחינות הסמכה וכדומה. לכן, בפנייה לשירותי רפואה אלטרנטיבית יש להיזהר מפני שרלטנים.
מרפאות שיניים